Mis a jour le 2022-09-03, 19:40

anndata et scanpy

anndata

package qui permet de stocker des matrices annotées
Définition d'un objet :
Metadata :
Manipulation :
Sauvegarde dans un fichier :
Concatenation d'objets selon les observations : adata = anndata.AnnData.concatenate(adata1, adata2, , adata3, batch_categories = ['a', 'b', 'c']) :

scanpy

Pré-processing :
Processing :
Graphes :

Copyright python-simple.com
programmer en python, tutoriel python, graphes en python, Aymeric Duclert